Le prix nobel de chimie a été attribué à Osamu Shimomura, Martin Chalfie et Roger Tsien pour la découverte et le développement de la GFP (Green Fluorescent Protein). Bien que je ne suis pas très sure que la GFP soit véritablement une découverte chimique (mais plutôt biologique), je suis ravis de cette attribution. Mais qu’est-ce que la GFP?
Tag - Gène
Le Gène égoïste
La théorie biologique du gène égoïste (selfish gene en version originale) constitue une remise en perspective de la théorie de l'évolution. Elle est due principalement à Richard Dawkins, qui l'a exposée dans un ouvrage du même nom paru en 1976.
La sélection naturelle dans le génome humain
Des chercheurs de l'Institut Pasteur et du CNRS publient dans Nature Genetics une étude de génétique des populations humaines menée à l'échelle du génome. Elle a permis d'identifier un ensemble de plus de 580 gènes qui ont vraisemblablement contribué à la diversité morphologique des populations, et à leurs différences en terme de sensibilité aux maladies. Dans ce dernier domaine, le travail des chercheurs ouvre des pistes d'investigation importantes pour l'étude des gènes de prédisposition à différentes pathologies.
Le mouton noir victime de la guerre des gènes
LONDRES (Reuters) - Le déclin du nombre de moutons noirs dans les troupeaux sauvages d'Ecosse est dû à une guerre des gènes, ont conclu des chercheurs de l'Université de Sheffield.
Par : Adrien Senecal Tags : Gène
Révision : Morphogène
Un morphogène est un gène qui code une protéine dont la fonction est de produire un gradient de concentration d'une molécule précise. Cette concentration ayant pour rôle de donner une information de position et d'induire différent type cellulaire selon celle-ci ; cela peut être mis en jeu dans la formation d'axe et de polarité.
Exemple d'une morphogène : le gène Bicoïde est un facteur de transcription qui active la transcription du gène Hunschback en région antérieur d'un œuf de drosophile. Le gène Nanos inhibe la traduction de l'ARNm Hunschback dans la partie postérieur de l'oeuf. Il n'y a donc pas de protéine hunschback en région postérieur. Il en résultat un fort gradient de concentration entre la région antérieur et postérieur de l'œuf de drosophile grâce à ces morphène.
Un surplus de bicoïde en région antérieur fait que la larve de la drosophile aura une tête surdimensionné. L'absence de bicoïde en région antérieur induira une larve sans tête.
Révision : Drosophile
Drosophila melanogaster, nom tiré du grec signifiant "amateur de rosée au ventre noir" est encore appelée mouche du vinaigre.
C'est un insecte diptère (donc à une seule paire d'ailes). C'est l'espèce de drosophile qui est en général utilisée dans des expériences en génétique ; elle appartient aux plus importants organismes modèles. Dans la littérature biologique contemporaine, elle est souvent désignée tout simplement sous le nom de son genre, Drosophila (qui contient pourtant de nombreuses autres espèces).
C'est un insecte diptère (donc à une seule paire d'ailes). C'est l'espèce de drosophile qui est en général utilisée dans des expériences en génétique ; elle appartient aux plus importants organismes modèles. Dans la littérature biologique contemporaine, elle est souvent désignée tout simplement sous le nom de son genre, Drosophila (qui contient pourtant de nombreuses autres espèces).
Révision : SINE/LINE
Un SINE (Short Interspersed Nuclear Element) est un élément répété dans le génome (l'ensemble de l'ADN).
Il fait partie de la famille des éléments transposables, c'est-à-dire des éléments qui n'ont pas de place fixe dans le génome tel un chromosome, mais au contraire qui s'insère n'importe où.
Une brève histoire de la biologie moléculaire
Les origines
C'est au cours de la deuxième moitié du dix neuvième siècle que l’ADN fut identifié pour la première fois. F. Miescher, un biochimiste suisse élève du célèbre professeur Hoppé-Sayler, isola en 1869 à partir des noyaux des cellules du pus une substance jusque là inconnue qu'il nomma d’abord nucléine. Il montra qu’elle contient du phosphore, contrairement à la plupart des molécules biologiques connues à cette époque. La caractérisation dans la composition chimique de la nucléine d’un sucre, le désoxyribose, et la reconnaissance de son caractère acide conduisirent à l’appeler ensuite acide désoxyribonucléique (ADN) mais son rôle biologique et sa structure restèrent encore longtemps inconnus et il fallu plus d’un siècle de recherches pour les établir.
En 1912, un physicien allemand, Max von Laue (1879-1960) avait découvert que les cristaux diffractent les rayons X et donnent alors sur une pellicule photographique une image formée d’un ensemble de taches symétriques car les rayons X ont des longueurs d'onde du même ordre de grandeur que les distances entre atomes. Cette découverte donna naissance à une nouvelle discipline, la radiocristallographie, qui permet par l’analyse de la distribution des taches de diffraction, de préciser la position des atomes dans le cristal. Deux physiciens anglais, le père et le fils Bragg, purent ainsi établir en 1914 la structure d'un cristal simple, celui de chlorure de sodium et reçurent le prix Nobel de physique en 1915. Le fils, sir Lawrence, créa ensuite à Cambridge un laboratoire spécialement destiné à l’étude des molécules biologiques. Le physicien britannique W. Astbury (1898-1961) fut le premier à étudier l’ADN par radiocristallographie X dans les années 1930 et à établir que sa structure présente la forme d’un long filament. Il inventa aussi le terme de biologie moléculaire et montra que l’ADN comporte une succession de bases empilées régulièrement dont il détermina sans se tromper l’espacement égal à 0,34 nm.
Quand une découverte génétique majeure rapproche science-fiction et réalité
CHICAGO (AFP) - Cultiver des organes en laboratoire pour les transplanter ou régénérer des membres amputés restent des exploits réservés à la science-fiction. Mais une découverte majeure sur les cellules souches dévoilée mardi a rapproché ce rêve un peu plus de la réalité.
Quelques exemples de gènes
Nous avons vu la dernière fois qu'il existe différents types d'allèle. Voyons quelques exemples!
Caractéristique génétique des allèles.
Après avoir expliqué les bases de la génétique, je voudrais revenir sur une notion importante : la caractéristiques des différents allèles. Retours sur la série "j'ai envie de vous parler un peu de ce que je fais"
Le comble de la connerie?
Un enfant de 7 ans exclu de l'école pour avoir dessiné un pistolet! A l'école primaire de Dennis Township, dans le New Jersey, on ne plaisante pas avec le règlement. Un enfant de sept ans l'a appris à ses dépends : un dessin représentant un pistolet lui a valu une journée d'exclusion. Sarkozy devrait faire séquencer son génome pour faire avancer les connaissances sur les gènes du dessinage de pistolet!
Un peu de génétique
Dans la série "j'ai envie de vous parler un peu de ce que je fais", je vais essayer de vous donner quelques notions de bases de génétique.
Du lait de vache allégé découvert par hasard après mutation génétique
Des scientifiques néo-zélandais élèvent une lignée de vaches dont le lait est pauvre en graisse, après la découverte par hasard d'une mutation génétique survenue spontanément chez un animal.
Par : Adrien Senecal Tags : Gène
Le rôle de l’affinité des interférons de type I à leur récepteur dans la transduction différenciée du signal
Lors de cette étude, nous avons voulu comprendre comment les différents interférons de type I peuvent, en utilisant le même récepteur et à concentrations égales, gouverner des réponses cellulaires spécifiques.
L’élément d’explication que nous développerons sera le lien entre les différentes affinités des sous-types d’IFN pour leur récepteur, et leurs conséquences sur la transduction.
Par Gendre Charles, Santo Julien et Senecal Adrien (étudiant en L3 biochimie).
Clonage, production, purification et étude d'interaction fonctionnelle d'une GTPase humaine TC10 et de son effecteur, la protéine PAK.
Le but de ce TP est d'étudier l'interaction entre la TC10 (une protéine qui appartient à la sous-famille Rho des petites GTPases) et la protéine PAK (connue pour être une cible de certaines protéine de cette sous-famille). Pour cela, deux voies vont être suivies :
- la première conduira à vérifier l'interaction in vitro. On utilisera Escherichia coli pour synthétiser les protéines et grâce à un pull down final on vérifiera la formation d'un complexe TC10-PAK.
- la seconde permettra de vérifier l'interaction in vivo. On utilisera pour cela des levures auxotrophes pour le tryptophane et la leucine. Grâce à un gène rapporteur, on pourra vérifier indirectement l'association TC10-PAK dans la levure.
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