Un SINE (Short Interspersed Nuclear Element) est un élément répété dans le génome (l’ensemble de l’ADN).
Il fait partie de la famille des éléments transposables, c’est-à-dire des éléments qui n’ont pas de place fixe dans le génome tel un chromosome, mais au contraire qui s’insère n’importe où.
Il existe deux catégories d’éléments transposables :
Les transposons ont deux catégories suivant le déplacement de leurs éléments :
Les retrotransposons possèdent également deux catégories :
Il existe deux catégories dans les éléments sans LTR :
Les SINEs peuvent servir de marqueurs moléculaires.
On attend d’un marqueur moléculaire qu’il soit polymorphisme, c’est-à-dire variable entre individus, et discriminant, c’est-à-dire qu’il permette de différencier des individus très proches.Le SINE est en cela un très bon marqueur moléculaire, puisqu’il présente un double polymorphisme (différence entre les individus).
Par exemple, si l’on obtient deux lignées différentes à partir d’un individu, avec un SINE (en bleu) qui s’insert dans la lignée de gauche (cf figure), on peut faire deux remarques :
On peut donc en conclure à partir de là, que deux individus ayant un SINE en commun, partagent donc un ancêtre en commun.